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Desde sempre a APCE procura estabelecer protocolos com diversas entidades, principalmente com instituições do ensino universitário, no sentido de aprofundar a cooperação entre a escola e as empresas no domínio da comunicação empresarial e interna.

A APCE estabeleceu protocolo com:

:. ASECOM em Fevereiro de 1991 em Salamanca

:. Universidade Nova de Lisboa no dia 24 de Junho de 1991, na Mãe d'Água das Amoreiras – Lisboa

:. Instituto Superior de Ciências da Informação e da Empresa (ISCIE) no dia 17 de Setembro de 1993, na Sede do STCP (Serviço de Transportes Colectivos do Porto)

:. Instituto Superior de Ciências Sociais e Políticas (ISCSP) no dia 9 de Novembro de 1993, no ISCSP, Junqueira – Lisboa

:. Escola Superior de Comunicação Social (ESCS) no dia 27 de Janeiro de 1999

:. Escola Superior de Educação da Guarda em 2002